More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2936 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 
489 aa  954    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  49.2 
 
 
487 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.02 
 
 
536 aa  342  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.09 
 
 
624 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  48.65 
 
 
657 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  56.07 
 
 
414 aa  310  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  48.9 
 
 
644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.39 
 
 
615 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.62 
 
 
583 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.62 
 
 
583 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.62 
 
 
583 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.23 
 
 
577 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  50.47 
 
 
583 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.3 
 
 
374 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.3 
 
 
374 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.3 
 
 
374 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  54.23 
 
 
784 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  49.36 
 
 
588 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  50 
 
 
592 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  50 
 
 
592 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  49.36 
 
 
588 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  50.32 
 
 
587 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  49.35 
 
 
632 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  49.35 
 
 
632 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.72 
 
 
570 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.5 
 
 
825 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  51.03 
 
 
804 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.93 
 
 
495 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  37.57 
 
 
524 aa  247  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.91 
 
 
503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  44.19 
 
 
592 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.2 
 
 
470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  32.76 
 
 
505 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.75 
 
 
484 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  35.39 
 
 
530 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.68 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.62 
 
 
462 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.05 
 
 
464 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  43.23 
 
 
521 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.59 
 
 
461 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.3 
 
 
393 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.44 
 
 
463 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.34 
 
 
460 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.34 
 
 
460 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.34 
 
 
460 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.14 
 
 
460 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35 
 
 
467 aa  226  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.61 
 
 
458 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  47.71 
 
 
729 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.3 
 
 
458 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  33.68 
 
 
479 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.3 
 
 
458 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  46.15 
 
 
585 aa  223  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.51 
 
 
460 aa  222  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.12 
 
 
474 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.62 
 
 
442 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.38 
 
 
388 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  44.53 
 
 
530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  42.76 
 
 
466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  47.95 
 
 
758 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.68 
 
 
513 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.57 
 
 
424 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  43.01 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  36.17 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.36 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  40.6 
 
 
375 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.01 
 
 
429 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.96 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.19 
 
 
435 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.73 
 
 
435 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.91 
 
 
435 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.91 
 
 
435 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.55 
 
 
551 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.55 
 
 
551 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.01 
 
 
437 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.09 
 
 
542 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  31.76 
 
 
443 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0930  GTP-binding signal recognition particle  42.54 
 
 
479 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.81 
 
 
485 aa  186  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  30.72 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.46 
 
 
379 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.46 
 
 
379 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.28 
 
 
527 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  32.53 
 
 
419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  37.11 
 
 
477 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.24 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  30.37 
 
 
447 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.12 
 
 
441 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  44.38 
 
 
437 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  34.4 
 
 
424 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  25.66 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  35.83 
 
 
452 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  31.56 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  42.46 
 
 
441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.88 
 
 
372 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  33.85 
 
 
481 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.57 
 
 
413 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  34.64 
 
 
468 aa  123  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.33 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  38.07 
 
 
341 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>