More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1620 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 592 aa  1190    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  74.67 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  42.34 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  53.16 
 
 		 530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  53.16 
 
 		 530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  51.91 
 
 		 548 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  48.7 
 
 		 479 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0930  GTP-binding signal recognition particle  47.21 
 
 		 479 aa  277  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.62 
 
 		 487 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.87 
 
 		 536 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.42 
 
 		 489 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.16 
 
 		 657 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.81 
 
 		 624 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.31 
 
 		 615 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.25 
 
 		 644 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.64 
 
 		 588 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.23 
 
 		 632 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.23 
 
 		 632 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.62 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.51 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.51 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.36 
 
 		 374 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.36 
 
 		 374 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.36 
 
 		 374 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.78 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.11 
 
 		 582 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.3 
 
 		 414 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.25 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  38.15 
 
 		 729 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.67 
 
 		 467 aa  206  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.12 
 
 		 784 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.34 
 
 		 825 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  30.95 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  41.11 
 
 		 375 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.72 
 
 		 464 aa  194  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.9 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.31 
 
 		 804 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.05 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.05 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.3 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.05 
 
 		 460 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.7 
 
 		 458 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.7 
 
 		 458 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.7 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.5 
 
 		 424 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.7 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.89 
 
 		 393 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.07 
 
 		 460 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.42 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.55 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  37.68 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  41.38 
 
 		 758 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.6 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.84 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.21 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.44 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.36 
 
 		 484 aa  173  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.11 
 
 		 379 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.11 
 
 		 379 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.98 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  36.79 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.91 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  38.4 
 
 		 427 aa  160  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.59 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.23 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  35.59 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  36.43 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.77 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.77 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.77 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.77 
 
 		 435 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.94 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.59 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  42.93 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  34.12 
 
 		 477 aa  146  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  32.08 
 
 		 527 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  32.39 
 
 		 424 aa  144  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  36.13 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  35.71 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  35.9 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  40.56 
 
 		 452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  38.98 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.09 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  32.43 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  33.15 
 
 		 481 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  34.83 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  36.08 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  27.03 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  36 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  32.11 
 
 		 389 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.74 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  36.21 
 
 		 419 aa  107  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  26.26 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  29.1 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.87 
 
 		 356 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  36.13 
 
 		 373 aa  104  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.77 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.81 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.81 
 
 		 484 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>