More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1173 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  100 
 
 		 424 aa  841    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.04 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.58 
 
 		 388 aa  206  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.62 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.74 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.89 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.89 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  31.64 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.5 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.5 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.02 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.8 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.66 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.59 
 
 		 825 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  32.51 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.89 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  39.01 
 
 		 505 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.83 
 
 		 503 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.19 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.19 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  39.86 
 
 		 466 aa  169  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.24 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  34.34 
 
 		 729 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.24 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.65 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.64 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.09 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.81 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  29.83 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.6 
 
 		 463 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.19 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.62 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.74 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.26 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.3 
 
 		 467 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  35.79 
 
 		 585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.44 
 
 		 513 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.3 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.09 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.55 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.16 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.16 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.19 
 
 		 804 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.68 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.23 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.87 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  31.78 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.19 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  32.39 
 
 		 592 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.58 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.25 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.07 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  35.92 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  35.34 
 
 		 442 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.64 
 
 		 551 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.64 
 
 		 551 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  33.33 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.4 
 
 		 489 aa  136  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.17 
 
 		 437 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.64 
 
 		 542 aa  136  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.71 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  32.42 
 
 		 758 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  26.51 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  31.94 
 
 		 521 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.06 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.06 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.51 
 
 		 373 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.25 
 
 		 592 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.25 
 
 		 592 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.02 
 
 		 624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.38 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  25.69 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.39 
 
 		 657 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.92 
 
 		 587 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  26.22 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.92 
 
 		 582 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 583 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 583 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 577 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  24.87 
 
 		 356 aa  126  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 583 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.11 
 
 		 615 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.93 
 
 		 588 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.93 
 
 		 588 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.85 
 
 		 784 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  32.64 
 
 		 548 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  25.99 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.52 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.76 
 
 		 570 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.76 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.98 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.11 
 
 		 632 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.11 
 
 		 632 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.89 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.1 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  25.92 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  33.81 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>