More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1399 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 
438 aa  891    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.76 
 
 
373 aa  237  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  31.19 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0377  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.39 
 
 
372 aa  209  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  47.83 
 
 
378 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  47.83 
 
 
378 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  34.04 
 
 
466 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  29.24 
 
 
395 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.09 
 
 
438 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.94 
 
 
400 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  28.63 
 
 
452 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.7 
 
 
413 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  30.8 
 
 
441 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.56 
 
 
389 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  28.51 
 
 
446 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  45.65 
 
 
403 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  29.13 
 
 
419 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.99 
 
 
437 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.09 
 
 
392 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.59 
 
 
356 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  42.55 
 
 
350 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.67 
 
 
402 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  48.31 
 
 
404 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.57 
 
 
372 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  42.93 
 
 
341 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.04 
 
 
423 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.1 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.5 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.5 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  43.43 
 
 
381 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.5 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.14 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  41.4 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  39.79 
 
 
447 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.42 
 
 
536 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  26.47 
 
 
427 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  38.78 
 
 
399 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  26.51 
 
 
424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.73 
 
 
626 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  41.8 
 
 
485 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0180  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.38 
 
 
657 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000220728  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.54 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  41.18 
 
 
441 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.46 
 
 
632 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.18 
 
 
362 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.46 
 
 
632 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  29.27 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  36.46 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.86 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.71 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.08 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  34.62 
 
 
466 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.84 
 
 
388 aa  127  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.5 
 
 
513 aa  126  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  38.74 
 
 
468 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  34.42 
 
 
446 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.83 
 
 
487 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.22 
 
 
481 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.33 
 
 
615 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  35.29 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.96 
 
 
551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.96 
 
 
551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.3 
 
 
388 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1846  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.48 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  35.91 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.91 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1547  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.95 
 
 
436 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.23 
 
 
542 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  36.84 
 
 
527 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.95 
 
 
474 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.05 
 
 
467 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1594  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.95 
 
 
436 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27 
 
 
489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.26 
 
 
644 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.96 
 
 
657 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.95 
 
 
436 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2391  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.86 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1558  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.95 
 
 
436 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.95 
 
 
624 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1768  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.95 
 
 
436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1737  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.41 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.88043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.73 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3607  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.41 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.41 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.3 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.11 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.11 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.89 
 
 
458 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1595  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.14 
 
 
281 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.16 
 
 
379 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.16 
 
 
379 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.28 
 
 
804 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.45 
 
 
446 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.63 
 
 
825 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.04 
 
 
470 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1386  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.87 
 
 
434 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.5 
 
 
458 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.92 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.92 
 
 
435 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.46 
 
 
570 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>