More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3850 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  93.4 
 
 
468 aa  843    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  100 
 
 
481 aa  964    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  58.49 
 
 
447 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  48.07 
 
 
452 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  46.71 
 
 
441 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  47.39 
 
 
441 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  41.43 
 
 
446 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  34.98 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  42.68 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  42.73 
 
 
437 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.58 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.89 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.87 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.31 
 
 
413 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.01 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.13 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  44.5 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.57 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.67 
 
 
626 aa  172  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  40.97 
 
 
341 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  44.5 
 
 
373 aa  169  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  43.15 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  43 
 
 
423 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.16 
 
 
463 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  42.55 
 
 
404 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.35 
 
 
467 aa  159  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.09 
 
 
464 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.76 
 
 
461 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.28 
 
 
484 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.28 
 
 
484 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.48 
 
 
470 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.01 
 
 
393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.51 
 
 
372 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.72 
 
 
458 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.09 
 
 
460 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.09 
 
 
460 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.09 
 
 
460 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.09 
 
 
460 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.29 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.6 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.71 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.01 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.81 
 
 
481 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.09 
 
 
458 aa  153  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.84 
 
 
513 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  33.81 
 
 
446 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.07 
 
 
474 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  42.86 
 
 
350 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.91 
 
 
458 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.91 
 
 
458 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  40.96 
 
 
466 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.91 
 
 
458 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.63 
 
 
460 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  42.7 
 
 
585 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.62 
 
 
400 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.98 
 
 
435 aa  149  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  41.97 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.8 
 
 
484 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.96 
 
 
462 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  44.07 
 
 
485 aa  148  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  41.9 
 
 
381 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.63 
 
 
503 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  42.63 
 
 
505 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.12 
 
 
495 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.5 
 
 
362 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2391  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.51 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.38 
 
 
424 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.08 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.94 
 
 
378 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.94 
 
 
378 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  41.15 
 
 
378 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.21 
 
 
373 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.76 
 
 
615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.82 
 
 
379 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.54 
 
 
379 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  36.08 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  36.92 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.04 
 
 
592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  36.92 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.04 
 
 
592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.04 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  34.92 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.04 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  40.31 
 
 
382 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.31 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.51 
 
 
644 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.98 
 
 
588 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
583 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
583 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
583 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
577 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.98 
 
 
588 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.6 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  35.6 
 
 
758 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  26.45 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.98 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.9 
 
 
804 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.98 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>