More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1434 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0809  signal recognition particle protein  77.78 
 
 		 445 aa  702    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0732  signal recognition particle protein  78 
 
 		 445 aa  702    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124171  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1297  signal recognition particle protein  77.1 
 
 		 445 aa  693    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1650  signal recognition particle protein  69.48 
 
 		 446 aa  642    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0675  signal recognition particle protein  88.79 
 
 		 446 aa  807    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.511297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1434  signal recognition particle protein  100 
 
 		 446 aa  897    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158506  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1039  signal recognition particle protein  79.02 
 
 		 448 aa  722    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00689452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0556  signal recognition particle protein  76.13 
 
 		 444 aa  689    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.521586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0997  signal recognition particle protein  76.23 
 
 		 445 aa  677    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0450  Signal recognition particle protein  60.82 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.768325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.6 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  42.18 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  42.46 
 
 		 446 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  43.63 
 
 		 448 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.34 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  43.65 
 
 		 469 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  42.76 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  42.39 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  44.73 
 
 		 446 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  42.47 
 
 		 443 aa  338  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  41.34 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  39.21 
 
 		 450 aa  336  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  42.06 
 
 		 458 aa  335  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  41.84 
 
 		 449 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  41.84 
 
 		 449 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  41.84 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  41.61 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  41.61 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  41.61 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  41.61 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  41.38 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  41.61 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.05 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  42.08 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  41.45 
 
 		 444 aa  332  9e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  41.38 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  41.38 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  41.38 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  41.14 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  44.64 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  44.74 
 
 		 450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 448 aa  329  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  40.65 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  41.04 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.47 
 
 		 447 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  38.85 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  41.24 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  44.03 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.94 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  39.55 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  39.55 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  41.75 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.35 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  39.3 
 
 		 447 aa  323  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.54 
 
 		 447 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  44.1 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  42.07 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  39.35 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  40.6 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  40.6 
 
 		 453 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.43 
 
 		 450 aa  319  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  41.23 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  41.98 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  40.65 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  40.23 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  41.04 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  41.04 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  41.04 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  41.04 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  41.04 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  37.95 
 
 		 544 aa  315  7e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  43.67 
 
 		 452 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  43.67 
 
 		 452 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  38.99 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.22 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  40.47 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  40.47 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  37.95 
 
 		 528 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  40.67 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  40.98 
 
 		 478 aa  313  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  40.27 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  41.28 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.31 
 
 		 492 aa  312  9e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  38.78 
 
 		 518 aa  312  9e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.44 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  42.31 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  40 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  39.82 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  38.57 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>