More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0540 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0540  signal recognition particle protein  100 
 
 		 449 aa  895    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.733534  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0551  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.3 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0377255  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0475  signal recognition particle protein  43.85 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.221272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  42.86 
 
 		 516 aa  359  6e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  41.19 
 
 		 511 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  41.47 
 
 		 446 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  42.06 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.06 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.71 
 
 		 491 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.01 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1080  signal recognition particle protein  42 
 
 		 447 aa  338  8e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  40.73 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  40.94 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  42.62 
 
 		 514 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.95 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  41 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.22 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  41 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  39.45 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.76 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  39.72 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  40.56 
 
 		 512 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.86 
 
 		 492 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 504 aa  326  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  42.14 
 
 		 517 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  42.14 
 
 		 514 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  38.92 
 
 		 551 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  40.28 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  40.48 
 
 		 526 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  39.27 
 
 		 462 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  41.57 
 
 		 443 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  40.48 
 
 		 520 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  41.36 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  39.29 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  40.48 
 
 		 522 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  41.9 
 
 		 516 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  40.71 
 
 		 520 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  40.71 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  41 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  40.76 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  40.48 
 
 		 521 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  39.02 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  39.53 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  42.22 
 
 		 498 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  39.11 
 
 		 521 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  38.12 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  39.15 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  39.46 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  40.43 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  40.42 
 
 		 487 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  40.69 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 487 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.48 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.92 
 
 		 490 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  38.86 
 
 		 448 aa  312  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1517  Signal recognition particle protein  39.11 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  38.93 
 
 		 520 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  38.01 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  40.86 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  39.26 
 
 		 518 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  37.81 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  39.49 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  39.34 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.41 
 
 		 447 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.33 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  40 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.72 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.37 
 
 		 521 aa  309  6.999999999999999e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  39.72 
 
 		 453 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>