More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0556 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0809  signal recognition particle protein  76.36 
 
 		 445 aa  693    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0997  signal recognition particle protein  74.61 
 
 		 445 aa  666    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1297  signal recognition particle protein  75.68 
 
 		 445 aa  685    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0556  signal recognition particle protein  100 
 
 		 444 aa  891    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.521586  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0732  signal recognition particle protein  76.14 
 
 		 445 aa  690    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1434  signal recognition particle protein  76.13 
 
 		 446 aa  704    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0675  signal recognition particle protein  75.28 
 
 		 446 aa  689    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.511297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1039  signal recognition particle protein  74.78 
 
 		 448 aa  682    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00689452  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1650  signal recognition particle protein  67.73 
 
 		 446 aa  616  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0450  Signal recognition particle protein  59.5 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.768325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  43.68 
 
 		 449 aa  346  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  45.88 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  42.99 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  42.99 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  45.07 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  42.99 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  43.75 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.91 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  41.88 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  42.15 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  43.99 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.48 
 
 		 443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  41.47 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  41.38 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  41.13 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  40.74 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  38.63 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  39.77 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  39.56 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.24 
 
 		 447 aa  322  6e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  38.67 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  41.57 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  40.79 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  38.63 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.51 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.04 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  41.61 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.66 
 
 		 462 aa  320  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  39.33 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  42.07 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  38.55 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  39.81 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  40.14 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  40.55 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  40 
 
 		 463 aa  315  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  40.09 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.17 
 
 		 551 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  41.27 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.66 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.77 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  39.86 
 
 		 485 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.95 
 
 		 507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  39.83 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  37.95 
 
 		 528 aa  312  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  39.83 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  39.72 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  38.33 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.39 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  38.99 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.29 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  39.49 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  40.33 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  41.23 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 478 aa  310  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  39.6 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  38.9 
 
 		 511 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  38.08 
 
 		 444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  37.95 
 
 		 544 aa  309  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  42.44 
 
 		 445 aa  308  9e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.64 
 
 		 454 aa  308  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  39.46 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  40.19 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  36.55 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  39.46 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.19 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  41.55 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.66 
 
 		 512 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  39.37 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  38.37 
 
 		 515 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.04 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  39.59 
 
 		 453 aa  306  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  39.21 
 
 		 443 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  39.34 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  39.34 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  39.34 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  39.34 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  37.33 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>