More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0675 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0675  signal recognition particle protein  100 
 
 		 446 aa  896    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.511297  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0809  signal recognition particle protein  77.95 
 
 		 445 aa  707    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0556  signal recognition particle protein  75.28 
 
 		 444 aa  673    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.521586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1650  signal recognition particle protein  67.57 
 
 		 446 aa  635    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1434  signal recognition particle protein  88.79 
 
 		 446 aa  807    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158506  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1297  signal recognition particle protein  77.27 
 
 		 445 aa  697    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0997  signal recognition particle protein  75.11 
 
 		 445 aa  672    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1039  signal recognition particle protein  79.33 
 
 		 448 aa  720    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00689452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0732  signal recognition particle protein  77.05 
 
 		 445 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124171  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0450  Signal recognition particle protein  60.14 
 
 		 447 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.768325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  41.67 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  43.86 
 
 		 469 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.79 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  44.84 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.34 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  41.94 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  41.94 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.05 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 449 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  41.92 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  41.94 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  41.94 
 
 		 449 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  41.94 
 
 		 449 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.01 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  41.89 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  41.08 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  42.06 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  41.45 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  40.78 
 
 		 440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  40.33 
 
 		 446 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  41.63 
 
 		 463 aa  329  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  40.91 
 
 		 463 aa  329  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  39.56 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  41.47 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.89 
 
 		 447 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  41.55 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  40.68 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  41.55 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  41.55 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  41.55 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  41.55 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  41.55 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  39.06 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  39.06 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  39.77 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  41.44 
 
 		 448 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.64 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  42.25 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  40.13 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  39.25 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  39.77 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  40.45 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  42.72 
 
 		 450 aa  320  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  41.15 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  38.86 
 
 		 457 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  39.72 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  40.19 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  40.43 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  43.68 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  41.51 
 
 		 455 aa  316  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.76 
 
 		 450 aa  316  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.79 
 
 		 512 aa  315  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  39.25 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  40.27 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  40.37 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  40.32 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  41.86 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000129048  hitchhiker  0.0000234744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  40.73 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  40.73 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.16 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  40.14 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0642  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.84 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.821014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  40.9 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  40.98 
 
 		 478 aa  313  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  40.5 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.39 
 
 		 481 aa  312  6.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.19 
 
 		 456 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  40.32 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  40.32 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  38.22 
 
 		 445 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  40.24 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  40.24 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  39.15 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  38.17 
 
 		 544 aa  310  2e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>