138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0680 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0680  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 330 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.665283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0533  GTP-binding signal recognition particle  35.4 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.868683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1470  GTP-binding signal recognition particle  27.71 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.9 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.9 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  32.31 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.5 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.89 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  27.12 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.04 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.16 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  23.58 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  21.49 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.38 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.38 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  26.56 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.58 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.94 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  26.98 
 
 		 446 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.69 
 
 		 437 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.32 
 
 		 469 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  28.1 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  22.6 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  27.18 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  28.51 
 
 		 524 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.05 
 
 		 447 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.91 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.9 
 
 		 481 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  28.63 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.18 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  27.56 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  29.02 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.19 
 
 		 429 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.46 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.17 
 
 		 484 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  26.62 
 
 		 403 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  28.57 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.66 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.17 
 
 		 484 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  30 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.48 
 
 		 464 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.96 
 
 		 495 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  28.36 
 
 		 472 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  29.66 
 
 		 459 aa  49.3  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.15 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30 
 
 		 503 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.62 
 
 		 423 aa  49.3  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  24.43 
 
 		 438 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0381  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  26.27 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.896845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  28.28 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  28.14 
 
 		 494 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  26.14 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.48 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0294  signal recognition particle  26.92 
 
 		 448 aa  47.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  26.14 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.71 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  28.65 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.27 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  28.11 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0930  GTP-binding signal recognition particle  28.74 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  29.73 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.88 
 
 		 458 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  25.76 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  25 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  27.03 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  29.05 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0888  cell division ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein FtsY  28.49 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  26.29 
 
 		 443 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  31.33 
 
 		 479 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  28.38 
 
 		 431 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  27.43 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  29.7 
 
 		 447 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  25.68 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.55 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.85 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  29.17 
 
 		 508 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.56 
 
 		 438 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  26.03 
 
 		 530 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1680  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.67 
 
 		 444 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.990278  normal  0.232979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  29.56 
 
 		 452 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  29.56 
 
 		 452 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  29.88 
 
 		 448 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  27.13 
 
 		 437 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  26.03 
 
 		 530 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  30.66 
 
 		 449 aa  46.2  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  27.64 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1440  signal recognition particle protein  29.31 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1563  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.62 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.33 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  31.17 
 
 		 585 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  26.67 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  26.74 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  30 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  28.89 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  29.19 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  24.63 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.28 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  27.64 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0390  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2149  signal recognition particle protein  30.05 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.449989  normal  0.0568824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>