More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf350 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  100 
 
 
441 aa  884    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0103  signal recognition particle protein  50 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0549  signal recognition particle protein  48.64 
 
 
447 aa  395  1e-109  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl479  signal recognition particle (signal binding protein)  47.43 
 
 
450 aa  388  1e-107  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.87256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  48.72 
 
 
469 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  48.95 
 
 
449 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  48.48 
 
 
449 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  48.48 
 
 
449 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  48.83 
 
 
446 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
449 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
449 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  48.02 
 
 
449 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
449 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
449 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  48.02 
 
 
449 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
449 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  48.48 
 
 
449 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  46.96 
 
 
446 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  47.88 
 
 
455 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  47.22 
 
 
449 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.04 
 
 
481 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  46.06 
 
 
453 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  46.67 
 
 
443 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  45.87 
 
 
433 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  44.55 
 
 
476 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  46.1 
 
 
433 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  43.78 
 
 
459 aa  368  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  47.84 
 
 
445 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  44.19 
 
 
445 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  46.6 
 
 
455 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  46.6 
 
 
455 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  49.13 
 
 
452 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  49.13 
 
 
452 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  45.27 
 
 
520 aa  363  4e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  45.21 
 
 
443 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  46.68 
 
 
435 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  42.66 
 
 
450 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.39 
 
 
447 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  43.94 
 
 
442 aa  360  4e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  45.03 
 
 
446 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  46.26 
 
 
444 aa  359  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  44.91 
 
 
521 aa  359  6e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  44.62 
 
 
518 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  43.71 
 
 
444 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.99 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  46.92 
 
 
448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  45.24 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  45.98 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  45.79 
 
 
449 aa  356  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.45 
 
 
446 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.61 
 
 
507 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.11 
 
 
512 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  42.59 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  42.49 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  44.73 
 
 
512 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  45.6 
 
 
444 aa  352  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  43.65 
 
 
450 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  45.14 
 
 
439 aa  352  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43 
 
 
496 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  42.12 
 
 
445 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  43.34 
 
 
492 aa  350  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  42.36 
 
 
449 aa  349  5e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  43.4 
 
 
448 aa  349  7e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  42.66 
 
 
485 aa  348  9e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.12 
 
 
447 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  45.37 
 
 
444 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  42.43 
 
 
441 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  44.71 
 
 
472 aa  348  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.07 
 
 
470 aa  347  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.83 
 
 
511 aa  347  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  44.83 
 
 
515 aa  346  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.19 
 
 
449 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  43.06 
 
 
492 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  43.06 
 
 
492 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  44.22 
 
 
467 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  42.6 
 
 
439 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  40.65 
 
 
449 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  42.76 
 
 
450 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  41.67 
 
 
449 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  41.72 
 
 
451 aa  344  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.81 
 
 
452 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  42.86 
 
 
462 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  43.99 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  44.76 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.89 
 
 
443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.06 
 
 
491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  43.19 
 
 
489 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  42.79 
 
 
508 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  41.94 
 
 
488 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  44.29 
 
 
515 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  42.44 
 
 
455 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  41.31 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  39.91 
 
 
449 aa  339  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  43.02 
 
 
456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  44.04 
 
 
454 aa  338  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  41.46 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  42.13 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  42.17 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  44.03 
 
 
493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  45.33 
 
 
454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>