77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0701 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  204  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  51.95 
 
 		 404 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  45.36 
 
 		 402 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  45.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  44.33 
 
 		 403 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  44.33 
 
 		 403 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  44.33 
 
 		 403 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  45.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  45.36 
 
 		 402 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  44.33 
 
 		 403 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  52.94 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  44.33 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  55.81 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 404 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  51.76 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  53.52 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 401 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  56.45 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 427 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 391 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  50 
 
 		 375 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  40.62 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 397 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 		 395 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  41.24 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  41.24 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  41.24 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  41.24 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 391 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 413 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 400 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 433 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 425 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  32.88 
 
 		 403 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 400 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 381 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 446 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  40 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32 
 
 		 395 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 413 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 443 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 390 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 386 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 386 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 433 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 403 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 409 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 439 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 464 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 388 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 423 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.99 
 
 		 417 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 396 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 401 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 405 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 417 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 387 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.8 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 402 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 385 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.09 
 
 		 451 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 387 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 397 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>