82 genes were found for organism Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Avi_9800  CDS  NC_011986  206  1435  +  1230  replication protein A  YP_002546471  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9801  CDS  NC_011986  1481  2518  +  1038  replication protein B  YP_002546472  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9802  CDS  NC_011986  2673  3887  +  1215  replication initiation protein RepC  YP_002546473  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9804  CDS  NC_011986  4021  4503  -  483  helix turn helix transcriptional regulator  YP_002546474  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9805  CDS  NC_011986  5117  5581  -  465  hypothetical protein  YP_002546475  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9806  CDS  NC_011986  5586  6287  -  702  chromosome partitioning protein  YP_002546476  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9807  CDS  NC_011986  6996  7397  +  402  mob protein  YP_002546477  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9808  CDS  NC_011986  7399  10161  +  2763  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  YP_002546478  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9810  CDS  NC_011986  10420  12519  -  2100  conjugative coupling protein  YP_002546479  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9811  CDS  NC_011986  12516  13538  -  1023  type IV secretion protein AvhB11  YP_002546480  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9812  CDS  NC_011986  13519  14727  -  1209  type IV secretion protein AvhB10  YP_002546481  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9813  CDS  NC_011986  14727  15536  -  810  type IV secretion protein AvhB9  YP_002546482  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9815  CDS  NC_011986  15533  16225  -  693  Type IV secretory pathway component VirB8  YP_002546483  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9816  CDS  NC_011986  16261  17289  -  1029  type IV secretion protein AvhB6  YP_002546484  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9817  CDS  NC_011986  17302  17529  -  228  hypothetical protein  YP_002546485  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9818  CDS  NC_011986  17522  18220  -  699  hypothetical protein  YP_002546486  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9819  CDS  NC_011986  18233  19321  -  1089  type IV system transglycosylase  YP_002546487  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9821  CDS  NC_011986  19318  21777  -  2460  type IV secretion protein AvhB4  YP_002546488  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9822  CDS  NC_011986  22081  22431  -  351  type IV secrection system pilin protein  YP_002546489  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9824  CDS  NC_011986  22444  23412  -  969  type IV system transglycosylase  YP_002546490  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9825  CDS  NC_011986  23570  24178  +  609  hypothetical protein  YP_002546491  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9826  CDS  NC_011986  24175  24714  +  540  hypothetical protein  YP_002546492  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9827  CDS  NC_011986  24711  25415  +  705  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  YP_002546493  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9829  CDS  NC_011986  25416  25796  +  381  hypothetical protein  YP_002546494  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9830  CDS  NC_011986  25801  26397  +  597  hypothetical protein  YP_002546495  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9831  CDS  NC_011986  26408  26833  +  426  hypothetical protein  YP_002546496  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9832  CDS  NC_011986  26850  27182  -  333  hypothetical protein  YP_002546497  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9833  CDS  NC_011986  27576  28208  +  633  Resolvase Protein  YP_002546498  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9834  CDS  NC_011986  28344  29264  -  921  hypothetical protein  YP_002546499  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9835  CDS  NC_011986  29463  31016  +  1554  transposase  YP_002546500  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9836  CDS  NC_011986  31029  31805  +  777  transposase  YP_002546501  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9837  CDS  NC_011986  32043  32372  +  330  transposase protein  YP_002546502  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9838  CDS  NC_011986  32369  33274  +  906  transposase  YP_002546503  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9841  CDS  NC_011986  33821  35170  -  1350  adenylate cyclase protein  YP_002546504  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9842  CDS  NC_011986  35256  35540  -  285  hypothetical protein  YP_002546505  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9844  CDS  NC_011986  35563  36042  -  480  copper tolerance protein  YP_002546506  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9845  CDS  NC_011986  36182  36451  -  270  hypothetical protein  YP_002546507  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9846  CDS  NC_011986  36644  37321  +  678  two component response regulator  YP_002546508  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9847  CDS  NC_011986  37308  38681  +  1374  two component sensor kinase  YP_002546509  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9848  CDS  NC_011986  38799  39083  -  285  hypothetical protein  YP_002546510  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9849  CDS  NC_011986  39106  39585  -  480  copper tolerance protein  YP_002546511  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9850  CDS  NC_011986  39618  40967  -  1350  multicopper oxidase  YP_002546512  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9851  CDS  NC_011986  40981  42441  -  1461  copper tolerance protein  YP_002546513  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9852  CDS  NC_011986  42438  42707  -  270  hypothetical protein  YP_002546514  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9853  CDS  NC_011986  42755  43141  -  387  hypothetical protein  YP_002546515  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9854  CDS  NC_011986  43389  43733  +  345  hypothetical protein  YP_002546516  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9856  CDS  NC_011986  43776  44204  +  429  hypothetical protein  YP_002546517  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9857  CDS  NC_011986  44214  44552  +  339  hypothetical protein  YP_002546518  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9859  CDS  NC_011986  44651  46864  -  2214  copper-translocating P-type ATPase  YP_002546519  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9861  CDS  NC_011986  47015  47299  -  285  hypothetical protein  YP_002546520  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9862  CDS  NC_011986  47523  48107  +  585  cytochrome C-like protein  YP_002546521  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9863  CDS  NC_011986  48119  48562  -  444  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  YP_002546522  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9864  CDS  NC_011986  48578  51058  -  2481  heavy-metal transporting P-type ATPase  YP_002546523  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9865  CDS  NC_011986  51211  51414  -  204  hypothetical protein  YP_002546524  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9866  CDS  NC_011986  51607  51993  +  387  hypothetical protein  YP_002546525  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9867  CDS  NC_011986  52116  52520  +  405  hypothetical protein  YP_002546526  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9868  CDS  NC_011986  52517  53944  +  1428  Membrane-fusion protein  YP_002546527  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9869  CDS  NC_011986  53941  57102  +  3162  AcrB/AcrD/AcrF family protein  YP_002546528  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9870  CDS  NC_011986  57117  57572  +  456  hypothetical protein  YP_002546529  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9871  CDS  NC_011986  57784  58347  -  564  hypothetical protein  YP_002546530  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9872  CDS  NC_011986  58507  58983  -  477  hypothetical protein  YP_002546531  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9873  CDS  NC_011986  59346  59786  -  441  hypothetical protein  YP_002546532  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9874  CDS  NC_011986  59946  60419  +  474  polysaccharide inhibition protein  YP_002546533  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9875  CDS  NC_011986  60578  61432  +  855  hypothetical protein  YP_002546534  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9878  CDS  NC_011986  61815  62087  -  273  hypothetical protein  YP_002546535  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9879  CDS  NC_011986  62304  62609  +  306  hypothetical protein  YP_002546536  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9881  CDS  NC_011986  63491  63730  +  240  hypothetical protein  YP_002546537  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9882  CDS  NC_011986  63730  64164  +  435  hypothetical protein  YP_002546538  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9884  CDS  NC_011986  64503  64832  -  330  hypothetical protein  YP_002546539  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9887  CDS  NC_011986  64947  66536  +  1590  transmembrane protein  YP_002546540  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9888  CDS  NC_011986  66526  67527  +  1002  hypothetical protein  YP_002546541  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9890  CDS  NC_011986  67980  68315  -  336  hypothetical protein  YP_002546542  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9896  CDS  NC_011986  69538  71475  +  1938  transcriptional regulator  YP_002546543  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9897  CDS  NC_011986  71437  71979  -  543  hypothetical protein  YP_002546544  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9898  CDS  NC_011986  72227  73132  -  906  transposase  YP_002546545  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9899  CDS  NC_011986  73129  73458  -  330  hypothetical protein  YP_002546546  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9901  CDS  NC_011986  73663  74943  +  1281  replication protein C  YP_002546547  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9903  CDS  NC_011986  74940  75446  +  507  succinoglycan biosynthesis protein  YP_002546548  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9904  CDS  NC_011986  75848  76183  +  336  hypothetical protein  YP_002546549  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9906  CDS  NC_011986  76304  76510  +  207  hypothetical protein  YP_002546550  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9907  CDS  NC_011986  76580  77644  +  1065  cell filamentation protein  YP_002546551  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9909  CDS  NC_011986  77873  78730  +  858  antirestriction protein  YP_002546552  n/a    n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>