12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9807 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9807  mob protein  100 
 
 		 133 aa  263  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6381  mobilisation protein  76.86 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4552  mobilisation protein  49.58 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4767  mobilisation protein  50.4 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153119  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4165  hypothetical protein  46.83 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.14726  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2791  mobilization protein  35 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0782  mobilisation protein  29.31 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816162  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0038  relaxosome component  34.21 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3653  hypothetical protein  31.37 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010485  EcSMS35_B0003  mobilization protein MbeC  32.93 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2405  mobilisation protein  28.42 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2323  mobilisation protein  34.74 
 
 		 109 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>