11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_B0003 on replicon NC_010485
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010485  EcSMS35_B0003  mobilization protein MbeC  100 
 
 		 115 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010672  SbBS512_C0003  mobilization protein MobC  91.59 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2405  mobilisation protein  33.33 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0004  hypothetical protein  29.59 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6381  mobilisation protein  35.37 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2796  mobilization protein  38.03 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245012  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4566  mobilisation protein  33.94 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9807  mob protein  32.93 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3788  hypothetical protein  36.78 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>