15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9830 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9830  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  58.99 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  52.28 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  55.15 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  39.09 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4449  hypothetical protein  33.17 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  31.31 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  28.12 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  26.02 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  26.74 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7343  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380725  normal  0.23952 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  32.74 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  36.9 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  32.91 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  34.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>