16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6220 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  56.82 
 
 
198 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9830  hypothetical protein  56.9 
 
 
198 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  48.66 
 
 
184 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  43.43 
 
 
161 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4449  hypothetical protein  35.33 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581783  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  25.14 
 
 
173 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  29.19 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  36.36 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  27.38 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  43.37 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  25.97 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  39.51 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  35.59 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  37.35 
 
 
192 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>