17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4350 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  358  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  53.37 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  186  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  44.38 
 
 
178 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6493  hypothetical protein  45.25 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  44.76 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  50.7 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  54.17 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  42.61 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2659  hypothetical protein  53.62 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  48.53 
 
 
212 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9830  hypothetical protein  29.82 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  32.89 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  27.12 
 
 
184 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  46.94 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  27.38 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  28.49 
 
 
198 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>