14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5040 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  41.67 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  46.25 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  52.17 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  49.32 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  62.5 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2659  hypothetical protein  60.42 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  48.53 
 
 
172 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  52.08 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  27.68 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  37.25 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  32.03 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6493  hypothetical protein  26.09 
 
 
171 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>