12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6413 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9830  hypothetical protein  58.08 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  53.54 
 
 		 181 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  44.83 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  35.2 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4449  hypothetical protein  28.93 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581783  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  36.7 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  28.11 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  40.79 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  26.7 
 
 		 178 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>