16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0874 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  35.19 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  35.58 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2659  hypothetical protein  33.1 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  34.64 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  36.88 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  39.13 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4449  hypothetical protein  36.59 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581783  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  39.74 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  37.33 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  37.29 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  31.69 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  41.67 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  36.99 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.29457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>