11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4449 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4449  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  35.87 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9830  hypothetical protein  33.17 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  29.51 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  32.39 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  42.86 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  30.81 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7343  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380725  normal  0.23952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  28.31 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  29.33 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>