More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L9_0009 on replicon NC_007107
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  100 
 
 
190 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  95.79 
 
 
190 aa  342  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  94.21 
 
 
190 aa  339  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  84.21 
 
 
190 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2169  integrase  76.22 
 
 
117 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  44.75 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  43.02 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  44.02 
 
 
180 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  41.85 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  42.39 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  43.82 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  42.93 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  41.85 
 
 
182 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  40.76 
 
 
180 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  40.76 
 
 
180 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  44.26 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  40.66 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  43.96 
 
 
189 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  42.22 
 
 
187 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  43.33 
 
 
180 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  43.1 
 
 
180 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  38.38 
 
 
186 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  39.66 
 
 
188 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  43.5 
 
 
187 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  39.11 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  39.11 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  39.11 
 
 
188 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  42.16 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  42.7 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  38.55 
 
 
188 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  37.99 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  37.99 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  37.99 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  38.46 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  38.17 
 
 
188 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  37.08 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  37.08 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  36.42 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  37.43 
 
 
179 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  37.43 
 
 
176 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  42.48 
 
 
169 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  38.01 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  38.01 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  38.01 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  38.01 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  38.01 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  38.01 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  38.01 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  38.3 
 
 
186 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  37.43 
 
 
176 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  37.43 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4348  integrase  88.24 
 
 
51 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0257445  hitchhiker  9.10332e-17 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  31.1 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  33.7 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  33.7 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  35.94 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  35.94 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  30.81 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  30.32 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  31.69 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  48.61 
 
 
73 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  31.69 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  27.55 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  27.55 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  27.04 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  32.62 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  30.65 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  27.89 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  28.25 
 
 
215 aa  74.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  33.33 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  27.33 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.21 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  30.23 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  28.21 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  29.65 
 
 
210 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  28.35 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  29.38 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  29.38 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  29.38 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  29.38 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  29.38 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  26.2 
 
 
291 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.22 
 
 
288 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  28.98 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  28.27 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.86 
 
 
284 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.5 
 
 
301 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  28.25 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 
332 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  28.49 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.75 
 
 
309 aa  58.9  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 
328 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  29.01 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  27.44 
 
 
361 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 
328 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.83 
 
 
285 aa  58.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  24.86 
 
 
278 aa  58.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  37.62 
 
 
97 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  27.27 
 
 
191 aa  57.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  31.14 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>