180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1173 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1173  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  494  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1167  hypothetical protein  97.06 
 
 
238 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  38.31 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  31.17 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  34.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  30.67 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  30.39 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  31.65 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  31.61 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.03 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  37.32 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  37.32 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.82 
 
 
555 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.82 
 
 
555 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  32.64 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  27.66 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  32.9 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  34.33 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  30.16 
 
 
504 aa  65.5  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  33.33 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  33.56 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  33.33 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  28.66 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.65 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.83 
 
 
219 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  37.72 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  35.21 
 
 
207 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  30.13 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  31.85 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  33.33 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.63 
 
 
554 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  30.16 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  34.29 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.15 
 
 
462 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.23 
 
 
340 aa  58.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  30.91 
 
 
582 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  27.27 
 
 
550 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.83 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  31.17 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  32.17 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.36 
 
 
552 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1557  uridine kinase  35.92 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.82 
 
 
558 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  29.49 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  28.85 
 
 
201 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  26.45 
 
 
215 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  31.82 
 
 
211 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.07 
 
 
555 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  32.17 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  24.84 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  24.52 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  32.59 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  24.68 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  24.23 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  25.58 
 
 
552 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  24.23 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  24.23 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  24.74 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  22.83 
 
 
547 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  28.85 
 
 
213 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.89 
 
 
553 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  24.74 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  24.74 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  24.74 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  27.92 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  30.92 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  24.23 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  28.57 
 
 
209 aa  52  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  24.81 
 
 
554 aa  52  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  28.95 
 
 
529 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  29.11 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  28.44 
 
 
325 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  29.11 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  31.51 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  24.2 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  23.71 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  23.27 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  29.11 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  31.29 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  31.29 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  27.56 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  23.71 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  24.84 
 
 
551 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  24.84 
 
 
551 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  27.56 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  26.71 
 
 
557 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  27.56 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  27.56 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  25.15 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  31.97 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.21 
 
 
553 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  30.92 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  23.04 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  27.74 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.71 
 
 
547 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  24.84 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  27.56 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  27.74 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  30.7 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.33 
 
 
315 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>