49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0042 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  46.88 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  45.36 
 
 		 97 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  44.33 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.79 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  47.92 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  49.49 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  43.02 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  43.75 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  40.82 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  38.89 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  42.35 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  39.39 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  35.05 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  58 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  36.59 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  42.67 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  36.46 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 93 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  38.27 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  32.58 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  31.46 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  31.46 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  29.67 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  30.34 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  34.65 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  31.11 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  25.84 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 96 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 96 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.46 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.55 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  46.34 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 91 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>