More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1742 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  97.5 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  70.89 
 
 		 250 aa  352  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  70.04 
 
 		 248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  49.13 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  40.68 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  45.49 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  42.92 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  41.2 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  40.6 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 		 250 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  43.98 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  43.83 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  42.53 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  43.57 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  41.28 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  41.3 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  38.16 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  40.17 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  40.62 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.36 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  30.94 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  39.49 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  31.55 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.65 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  38.3 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.3 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  37.93 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  32.45 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  29.84 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.79 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  36.11 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  29.58 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  35.19 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.96 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.75 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  30.3 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  32.8 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  36.93 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  31.55 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  40 
 
 		 516 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  32.73 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  43.56 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  35.51 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  30.95 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  38.71 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  35.51 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  28.57 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  35.29 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  29.81 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.17 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  30.36 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.33 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  37.61 
 
 		 511 aa  68.6  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  33.12 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  28.17 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  35.92 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.68 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  28 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  35 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  34.38 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  35.77 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  31.38 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  35.14 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  33.08 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  27.78 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.4 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  25.84 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>