More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1528 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1528  response regulator receiver protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1471  response regulator receiver protein  98.31 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0303937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01720  response regulator  55.6 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2972  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.538919  hitchhiker  0.000910386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 1266 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  30.56 
 
 		 1083 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  27.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  27.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 916 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.77 
 
 		 781 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.41 
 
 		 937 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1007 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1695  GacS/BarA family sensor protein  27.5 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  30.9 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  33.91 
 
 		 949 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.23 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 654 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  28.49 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.72 
 
 		 937 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 759 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2439  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6296  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.98 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312585  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 841 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 916 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  25 
 
 		 933 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 		 922 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.12 
 
 		 929 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1173  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2240  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573737  hitchhiker  0.00000360672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 		 847 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1767 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.41 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.67 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.45 
 
 		 956 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 917 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  25.81 
 
 		 917 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.14 
 
 		 917 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.21 
 
 		 935 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2280  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 928 aa  58.9  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  34.13 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 		 932 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 451 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.667822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1176  hypothetical protein  27.42 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1182  hypothetical protein  27.42 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2531  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.47 
 
 		 1763 aa  58.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  26.79 
 
 		 1098 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.28 
 
 		 662 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  21.63 
 
 		 987 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  27.44 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.74 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.17 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  28.57 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.17 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.77 
 
 		 948 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 		 857 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 857 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  38.32 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 917 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.99 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  30.45 
 
 		 855 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  26.11 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  28.46 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  31.19 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  28.46 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0142  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.42 
 
 		 933 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.73 
 
 		 935 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 		 1226 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.43 
 
 		 933 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1492  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1029 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  26.98 
 
 		 914 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 701 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  32.77 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  28.05 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.56 
 
 		 1692 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>