56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0534 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  684    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  99.71 
 
 		 345 aa  683    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  81.68 
 
 		 341 aa  508  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  56 
 
 		 355 aa  364  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  55.43 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  55.43 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  55.03 
 
 		 341 aa  360  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  54.73 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  57.14 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  53.72 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  57.31 
 
 		 359 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  56.18 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  54.94 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  50.94 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  46.78 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  49.21 
 
 		 379 aa  301  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  47.08 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  46.92 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  48.75 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  46.33 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  47.08 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  45.72 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  46.65 
 
 		 419 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  46.76 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  47.66 
 
 		 422 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  46.61 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  45.27 
 
 		 324 aa  280  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  50.48 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  48.87 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  46.92 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  46.45 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  50.95 
 
 		 374 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  48.18 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  47.73 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  44.38 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  45.91 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  44.38 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  44.51 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  43.15 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  48.41 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  49.37 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  44.06 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.29 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  40.2 
 
 		 356 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  31.95 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  31.13 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  31.67 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  31.54 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  29.14 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  36.14 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  28.8 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  32.53 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  34.62 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  31 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  31.75 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  29.81 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>