52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1007 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  55.27 
 
 
355 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  55.27 
 
 
355 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  56.98 
 
 
354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  55.27 
 
 
355 aa  359  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  54.87 
 
 
341 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  57.48 
 
 
359 aa  349  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  53.51 
 
 
355 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  53.93 
 
 
362 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  57.73 
 
 
348 aa  332  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  57.36 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  54.73 
 
 
345 aa  323  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  54.44 
 
 
345 aa  322  5e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  50 
 
 
353 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  51.98 
 
 
364 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  51.24 
 
 
380 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  52.15 
 
 
348 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  48.05 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  49.12 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  48.68 
 
 
363 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  47.66 
 
 
364 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  49.3 
 
 
390 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  47.35 
 
 
353 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  47.8 
 
 
380 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  46.92 
 
 
355 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  47.16 
 
 
324 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  49.5 
 
 
319 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  50.32 
 
 
339 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  49.45 
 
 
379 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  49.12 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  49.84 
 
 
361 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  46.49 
 
 
348 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  47.9 
 
 
325 aa  278  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  45.91 
 
 
360 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  45.61 
 
 
360 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  50.56 
 
 
374 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  47.64 
 
 
419 aa  272  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  50 
 
 
383 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  46.27 
 
 
422 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  46.07 
 
 
365 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  43.15 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  48.26 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.61 
 
 
355 aa  253  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  39.93 
 
 
356 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  35.43 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  34.53 
 
 
309 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  30.19 
 
 
323 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  34.31 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  35.37 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  35.9 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  33.75 
 
 
255 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>