56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02894 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  675    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  81.68 
 
 
345 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  81.38 
 
 
345 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  57.36 
 
 
333 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  62.24 
 
 
359 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  54.03 
 
 
341 aa  355  7.999999999999999e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  56.94 
 
 
355 aa  352  8e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  56.36 
 
 
355 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  56.36 
 
 
355 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  57.01 
 
 
354 aa  345  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  57.8 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  53.63 
 
 
380 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  55.49 
 
 
348 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  51.31 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  46.99 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  47.02 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  50.27 
 
 
379 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  49.55 
 
 
364 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  46.15 
 
 
363 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  45.54 
 
 
363 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  49.21 
 
 
324 aa  288  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  46.2 
 
 
348 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  48.69 
 
 
364 aa  278  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  48.61 
 
 
419 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  43.88 
 
 
350 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  48.29 
 
 
383 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  46.99 
 
 
390 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  46.77 
 
 
422 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  49.35 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  45.15 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  45.51 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  47.94 
 
 
361 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  44.41 
 
 
359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  46.86 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  46.04 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  46.04 
 
 
360 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  45.43 
 
 
365 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  46.46 
 
 
348 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  46.5 
 
 
325 aa  262  8e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  49.41 
 
 
374 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  46.91 
 
 
365 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  48.6 
 
 
339 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  44.07 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  41.14 
 
 
356 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  32.59 
 
 
309 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  30.23 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  31.54 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.43 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  28.99 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0915  Integral membrane protein TerC  24.81 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.92605e-32 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  28.97 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  29.52 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  25.4 
 
 
320 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  28.85 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  28.85 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>