52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2044 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  699    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  59.83 
 
 
348 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  56.43 
 
 
353 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  55.72 
 
 
363 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  56.6 
 
 
363 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  58.06 
 
 
365 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  55.14 
 
 
360 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  54.86 
 
 
360 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  53.87 
 
 
355 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  54.52 
 
 
353 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  54.26 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  56.09 
 
 
319 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  54.05 
 
 
364 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  53.51 
 
 
333 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  50.3 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  46.55 
 
 
350 aa  322  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  57.24 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  48.54 
 
 
359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  46.18 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  45.92 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  45.92 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  47.43 
 
 
354 aa  301  9e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  47.66 
 
 
359 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  45.58 
 
 
355 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  46.78 
 
 
345 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  46.78 
 
 
345 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  45.85 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  47.02 
 
 
341 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45.81 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  45.01 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  46.34 
 
 
364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  46.95 
 
 
324 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  45.21 
 
 
390 aa  266  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  45.57 
 
 
419 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  45.27 
 
 
379 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  44.31 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  45.17 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  47.08 
 
 
383 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  43.88 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  43.8 
 
 
325 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  44.23 
 
 
355 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  44.04 
 
 
422 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  41.83 
 
 
365 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  36.54 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  34.3 
 
 
309 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  32.21 
 
 
294 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  30.41 
 
 
323 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  33.44 
 
 
308 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.55 
 
 
307 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  29.09 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  34.94 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  35 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>