52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0076 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  80.94 
 
 		 355 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  80.66 
 
 		 355 aa  559  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  80.66 
 
 		 355 aa  559  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  80.78 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  59.78 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  57.87 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  54.78 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  57.3 
 
 		 345 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  57.02 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  49.59 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  57.3 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  49.46 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  46.42 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  45 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  50 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  45.71 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  45.68 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  46.93 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  49.27 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  46.54 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  48.32 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  43.45 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  46.41 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  47.56 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  43.61 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  45.94 
 
 		 365 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  50.47 
 
 		 383 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  45.15 
 
 		 363 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  48.47 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  45.82 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  48.53 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  45.71 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  42.82 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  43.16 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  45.07 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  42.47 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  42.74 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  41.83 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  41.13 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  45.71 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  43.36 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  43.42 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  38.69 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  29.19 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  28.66 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  32.55 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  29.01 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  26.3 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  31.58 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  25.61 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>