49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2489 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  100 
 
 		 374 aa  731    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  64.52 
 
 		 380 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  65.77 
 
 		 379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  64.31 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  59.95 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  62.4 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  57.6 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  59.02 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  53.44 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  51.08 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  51.08 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  52.14 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  52.38 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  53.19 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  50.27 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  50.97 
 
 		 333 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  48.15 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  48.53 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  46.98 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  51.5 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  51.5 
 
 		 345 aa  279  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.36 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  47.62 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  50.89 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  42.39 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  42.43 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  45.37 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  44.8 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  46.76 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  45.37 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  42.9 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  44.31 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  45.95 
 
 		 348 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  42.59 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  44.01 
 
 		 360 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  42.09 
 
 		 360 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  43.24 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  43.24 
 
 		 319 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  43.75 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  43.54 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  43.66 
 
 		 350 aa  236  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  39.61 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  41.27 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  41.12 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  30.21 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  29.67 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  30.67 
 
 		 307 aa  91.3  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  39.25 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>