49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1193 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  662    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  59.54 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  52.21 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  55.06 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  52.11 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  50.68 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  50.55 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  52.5 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  53.17 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  48.87 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  48.26 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  46.69 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  47.81 
 
 		 353 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  45.63 
 
 		 348 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  48.23 
 
 		 319 aa  262  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  47.42 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  47.81 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  48.09 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.61 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  45.95 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  44.48 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  46.13 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  44.32 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  44.32 
 
 		 355 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  44.32 
 
 		 355 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  44.44 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  44.44 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  44.51 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45.86 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  42.52 
 
 		 359 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  48.41 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  48.13 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  44.9 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  46.82 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  45.93 
 
 		 341 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  46.47 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  45.86 
 
 		 360 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  45.86 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  42.06 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  41 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  48.25 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  44.73 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  41.31 
 
 		 348 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  36.88 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  32.61 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  34.17 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  32.97 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.84 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>