53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13660 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  719    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  61.85 
 
 
364 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  59.73 
 
 
380 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  56.95 
 
 
379 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  59.19 
 
 
374 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  56.15 
 
 
419 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  53.15 
 
 
383 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  51.61 
 
 
380 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  48.31 
 
 
339 aa  299  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  48.58 
 
 
390 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  45.41 
 
 
355 aa  291  9e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  45.41 
 
 
355 aa  291  9e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  45.41 
 
 
355 aa  289  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  45.28 
 
 
354 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  46.07 
 
 
333 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  47.12 
 
 
422 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45.82 
 
 
362 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.22 
 
 
355 aa  266  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  43.09 
 
 
341 aa  259  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  46.09 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  44.44 
 
 
359 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  41.94 
 
 
355 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  41.69 
 
 
353 aa  245  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  41.42 
 
 
355 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  43.5 
 
 
319 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  49.54 
 
 
345 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  43.49 
 
 
353 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  49.24 
 
 
345 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  38.76 
 
 
359 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  47.16 
 
 
341 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  44.06 
 
 
361 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  41.16 
 
 
364 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  42.31 
 
 
360 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  44.51 
 
 
365 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  42.03 
 
 
360 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  40.98 
 
 
363 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  40.27 
 
 
363 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  42.9 
 
 
348 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  38.94 
 
 
325 aa  223  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  41.11 
 
 
348 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  42.17 
 
 
356 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  40.61 
 
 
350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  41.94 
 
 
348 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  36.44 
 
 
324 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  31.37 
 
 
323 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  31.55 
 
 
294 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  31.37 
 
 
309 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.07 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  31.4 
 
 
308 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2735  Integral membrane protein TerC  31.2 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3367  Integral membrane protein TerC  31.2 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.50286  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  26.55 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  26.92 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>