52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3632 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  93.11 
 
 
363 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  83.57 
 
 
353 aa  591  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  83.43 
 
 
365 aa  554  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  74.21 
 
 
360 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  76.52 
 
 
364 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  74.21 
 
 
360 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  75.37 
 
 
361 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  63.84 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  65.19 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  60.29 
 
 
348 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  67.32 
 
 
319 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  58.24 
 
 
350 aa  391  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  56.6 
 
 
355 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  56.76 
 
 
348 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  49.12 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  52.48 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  45.98 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  46.18 
 
 
355 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  46.18 
 
 
355 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  45.59 
 
 
341 aa  286  5e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  47.26 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  45.61 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  45.87 
 
 
354 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  43.57 
 
 
380 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  46.92 
 
 
345 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  46.92 
 
 
345 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  43.78 
 
 
390 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  46.41 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  44.15 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  45.54 
 
 
341 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  43.04 
 
 
379 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  42.72 
 
 
422 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  42.03 
 
 
419 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  43.79 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  42.57 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  44.44 
 
 
339 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  45.51 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  45.43 
 
 
383 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.71 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  42.65 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  45.37 
 
 
374 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  40.98 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  37.75 
 
 
356 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  34.88 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  30.27 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  32.7 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  33.56 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  31.35 
 
 
308 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  31.13 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  33.33 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  28.57 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>