54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3015 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  64.29 
 
 		 380 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  63.59 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  65.22 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  60.41 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  56.95 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  56.05 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  57.3 
 
 		 383 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  52.66 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  50.55 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  53.49 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  50.55 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  49.56 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  47.57 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  47.57 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  47.33 
 
 		 355 aa  298  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  49.45 
 
 		 333 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  49.21 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  49.21 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  47.07 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  45.23 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  50.27 
 
 		 341 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.55 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  42.52 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  43.04 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  46.32 
 
 		 339 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  50.29 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  43.2 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  43.2 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  44.19 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  44.28 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  43.54 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  43.27 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  42.7 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  42.19 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  41.3 
 
 		 325 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  42.02 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  44 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  42.02 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  40.05 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  45.5 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  43.23 
 
 		 361 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  39.78 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  39.09 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  33.72 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  32.83 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  29.62 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.46 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  33.72 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  29.71 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  26.32 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  28.57 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  28.57 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  26.83 
 
 		 313 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>