52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6115 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  83.57 
 
 		 363 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  81.43 
 
 		 363 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  80.68 
 
 		 365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  76.72 
 
 		 360 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  76.72 
 
 		 360 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  75.64 
 
 		 364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  76.52 
 
 		 361 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  68.73 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  68.15 
 
 		 353 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  69.61 
 
 		 319 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  61.78 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  59.18 
 
 		 350 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  56.43 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  55.46 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  319  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  54.46 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  47.65 
 
 		 341 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  49.84 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  45.77 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  45.35 
 
 		 355 aa  296  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  45.35 
 
 		 355 aa  296  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  45.51 
 
 		 355 aa  295  6e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  46.18 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  46.99 
 
 		 341 aa  278  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  43.4 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  47.08 
 
 		 345 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  46.78 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  45 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  43.63 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  42.52 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  40.91 
 
 		 419 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  47.45 
 
 		 339 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  45.27 
 
 		 325 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  43.53 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  42.28 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  40.91 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.57 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  46.08 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  42.35 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  42.43 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  43.49 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  35 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  33.89 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  34.19 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  33 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  30.98 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  31.6 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  31.13 
 
 		 255 aa  49.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  32.63 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  31.07 
 
 		 266 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>