80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3191 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  100 
 
 
383 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  61.41 
 
 
364 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  59.9 
 
 
419 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  58.38 
 
 
379 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  60.27 
 
 
380 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  55.24 
 
 
380 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  56.68 
 
 
390 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  58.74 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  57.06 
 
 
422 aa  338  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  52.88 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  50.84 
 
 
339 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  53.8 
 
 
354 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  49.73 
 
 
355 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  49.73 
 
 
355 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  51.14 
 
 
333 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  48.33 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  51.46 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  47.67 
 
 
362 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  45.15 
 
 
341 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  43.37 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  48.88 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  48.88 
 
 
345 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  46.15 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  45.75 
 
 
353 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  46.63 
 
 
339 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  46.54 
 
 
365 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  44.48 
 
 
325 aa  266  5e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  45.12 
 
 
363 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  47.73 
 
 
341 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  47.76 
 
 
355 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  45.86 
 
 
363 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  46.07 
 
 
360 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  45.58 
 
 
364 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  46.07 
 
 
360 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  42.02 
 
 
324 aa  256  7e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  43.47 
 
 
356 aa  255  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  43.65 
 
 
353 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  46.83 
 
 
359 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  43.25 
 
 
355 aa  255  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  46.13 
 
 
361 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  44.07 
 
 
348 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  45.4 
 
 
319 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  43.65 
 
 
348 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  40.33 
 
 
350 aa  240  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  33.03 
 
 
309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  29.05 
 
 
323 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  34.01 
 
 
294 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  31.91 
 
 
307 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  32.87 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  25.75 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  27.97 
 
 
320 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  28.35 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  30 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  29.36 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  33.86 
 
 
266 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  21.43 
 
 
308 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  29.23 
 
 
317 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  25 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  25.79 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  24.43 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  24.43 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  23.04 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  27.13 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  27.33 
 
 
311 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  28.33 
 
 
255 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  27.13 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  25.64 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  22.35 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  27.13 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  27.13 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  27.13 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  27.13 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  27.13 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  27.13 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  20.83 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  34.15 
 
 
271 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  28.83 
 
 
314 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  27.1 
 
 
255 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  26.21 
 
 
314 aa  42.7  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  26.21 
 
 
314 aa  42.7  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>