49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0017 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  638    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  62.31 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  47.9 
 
 
333 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  44.51 
 
 
359 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  43.3 
 
 
355 aa  262  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  43.3 
 
 
355 aa  262  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  46 
 
 
354 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  45.29 
 
 
364 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  43.02 
 
 
355 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  45.27 
 
 
353 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  43.8 
 
 
355 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  45.29 
 
 
359 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  42.57 
 
 
363 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  44.38 
 
 
360 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  43.77 
 
 
353 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  43.64 
 
 
355 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  44.48 
 
 
360 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  41.41 
 
 
348 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  44.48 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  44.84 
 
 
365 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  42.57 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  45.28 
 
 
383 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  40.56 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  40.33 
 
 
380 aa  241  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  46.58 
 
 
361 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  44.98 
 
 
319 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  42.48 
 
 
348 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  44.78 
 
 
339 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  41.96 
 
 
379 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  46.5 
 
 
341 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  42.3 
 
 
362 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  43.48 
 
 
345 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  40.8 
 
 
339 aa  229  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  43.48 
 
 
345 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  42.32 
 
 
350 aa  227  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  39.57 
 
 
390 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  39.66 
 
 
348 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  42.9 
 
 
355 aa  219  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  41.85 
 
 
422 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  39.89 
 
 
380 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  38.94 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  39.58 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  39.44 
 
 
374 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  33.65 
 
 
356 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  30.77 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  33.96 
 
 
323 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.44 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  33.7 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>