53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4752 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  100 
 
 		 380 aa  747    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  72.68 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  64.29 
 
 		 379 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  62.5 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  64.23 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  59.73 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  53.32 
 
 		 380 aa  371  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  60.27 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  52.21 
 
 		 339 aa  339  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  51.22 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  51.24 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  51.62 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  50.85 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  49.42 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  46.52 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  46.52 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  45.68 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  50.94 
 
 		 345 aa  289  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  45.5 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  50.67 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.85 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  48.68 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45.99 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  51.31 
 
 		 341 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  45.99 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  41.37 
 
 		 359 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  46.52 
 
 		 348 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  42.18 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  41.91 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  43.09 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  43.84 
 
 		 319 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  40.91 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  44.25 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  43.79 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  41.44 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  41.09 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  40.11 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  42.61 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  40.16 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  42.22 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  42.65 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  38.19 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  33.62 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  29.2 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  30.09 
 
 		 294 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  34.9 
 
 		 307 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  30 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  29.86 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  28.69 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  30 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>