51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0244 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  59.83 
 
 
355 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  55.46 
 
 
353 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  56.76 
 
 
363 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  55.46 
 
 
363 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  54.76 
 
 
353 aa  352  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  54.9 
 
 
365 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  53.71 
 
 
355 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  53.04 
 
 
360 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  53.04 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  55.39 
 
 
364 aa  338  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  54.81 
 
 
361 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  51.32 
 
 
348 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  54.9 
 
 
319 aa  325  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  50.59 
 
 
350 aa  322  8e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  48.59 
 
 
355 aa  315  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  48.59 
 
 
355 aa  315  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  49.15 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  52.15 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  49.29 
 
 
354 aa  309  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  47.65 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  54.97 
 
 
339 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  46.47 
 
 
341 aa  289  4e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45.71 
 
 
362 aa  286  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  46.33 
 
 
345 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  46.04 
 
 
345 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  44.31 
 
 
359 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  45.71 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  45.63 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  41.96 
 
 
380 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  45.66 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  42.69 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  46.96 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  44.44 
 
 
364 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  44.25 
 
 
380 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  45.34 
 
 
422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  43.72 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  45.03 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  42.48 
 
 
325 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  43.2 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  44 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  39.13 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  41.11 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  37.42 
 
 
356 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  34.68 
 
 
294 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  33.46 
 
 
323 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  44.83 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0990  Integral membrane protein TerC  39.24 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>