49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  41.11 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  40.16 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  39.32 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  42.65 
 
 		 383 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  40.21 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  38.41 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  38.42 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  36.87 
 
 		 355 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  36.87 
 
 		 355 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  41.23 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  37.07 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  39.88 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  37.98 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  37.64 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  39.39 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  38 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  40.45 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  39.34 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  40.15 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  38.89 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  34.59 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  34.46 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  40.22 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  38.24 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  36.78 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  37.61 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  35.19 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  40.06 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  36.39 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  36.47 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  41.59 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  35.71 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  35.12 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  36.31 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  34.47 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  40.35 
 
 		 348 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  36.41 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  36.13 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  37.11 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  36.31 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  36 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  36.77 
 
 		 361 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  34.88 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  31.5 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  28.39 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  30.22 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  28.53 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>