50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0312 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  75.64 
 
 		 353 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  76.12 
 
 		 363 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  76.52 
 
 		 363 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  77.52 
 
 		 360 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  77.49 
 
 		 360 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  79.42 
 
 		 361 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  75.71 
 
 		 365 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  64.83 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  64.12 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  64.5 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  65.8 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  56.68 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  54.05 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  55.39 
 
 		 348 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  55.78 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  48.83 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  48.06 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  47.18 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  47.18 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  46.59 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  48.44 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  45.59 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  46.29 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  45.98 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  44.09 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  45 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  45.88 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  47.48 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  46.92 
 
 		 345 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  46.63 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  43.41 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  46.13 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  42.29 
 
 		 379 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  42.46 
 
 		 419 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  42.93 
 
 		 380 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  43.96 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  46.69 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  44.41 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  43.99 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  43.15 
 
 		 355 aa  234  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  42.2 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  41.99 
 
 		 365 aa  226  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  35.92 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  32.69 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  32.89 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  33.55 
 
 		 307 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  32.28 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  34.5 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  33.02 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>