50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3676 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  754    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  81.1 
 
 
422 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  54.32 
 
 
380 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  53.12 
 
 
380 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  54.79 
 
 
379 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  55.84 
 
 
383 aa  345  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  54.26 
 
 
364 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  52.33 
 
 
419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  48.72 
 
 
354 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  49.13 
 
 
355 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  49.13 
 
 
355 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  49.3 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  47.98 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  49.07 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  52 
 
 
374 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  47.38 
 
 
341 aa  296  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  48.55 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  43.63 
 
 
353 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  44.05 
 
 
363 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  43.78 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.21 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  44.44 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  43.75 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  43.21 
 
 
355 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  45.23 
 
 
360 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  44.76 
 
 
360 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.58 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  45.12 
 
 
319 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  45.48 
 
 
339 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  45.38 
 
 
348 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  43.41 
 
 
364 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  46.61 
 
 
361 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  42.08 
 
 
348 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  40.87 
 
 
359 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  47.42 
 
 
341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  41.87 
 
 
324 aa  263  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  47.73 
 
 
345 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  44.75 
 
 
339 aa  260  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  47.43 
 
 
345 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  44.61 
 
 
359 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  43.85 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  42.01 
 
 
365 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  41.19 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  39.89 
 
 
356 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  30.54 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  31.56 
 
 
309 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  30.34 
 
 
294 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  30.89 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  41.07 
 
 
308 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  37.33 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>