55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0346 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  68.54 
 
 		 308 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  67.1 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  65.31 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  55.56 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  34.62 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  34.88 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  34.29 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  34.44 
 
 		 363 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  33.89 
 
 		 353 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  34.78 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  33.22 
 
 		 360 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  34.42 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  34.3 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  32.58 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  32.21 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  34.53 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  33.14 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  33.54 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  34.37 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  31.42 
 
 		 380 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  33.77 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  32.58 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  32.11 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  33.62 
 
 		 380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  31.6 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  32.59 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  32 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  31.62 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  34.32 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  32.19 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  29.35 
 
 		 355 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  29.35 
 
 		 355 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  31.23 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  29.45 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  32.46 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  31.23 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  30.23 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  32.85 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  31.6 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  31.23 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  30.89 
 
 		 422 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  31.6 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  31.54 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  28.53 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  31.56 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  40.87 
 
 		 419 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  35.29 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  29.11 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1776  integral membrane protein TerC  24.29 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.221136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0578  Integral membrane protein TerC  22.31 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.592878 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  25.45 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  25.45 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  25.45 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>