51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0764 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  695    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  96.62 
 
 
355 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  96.62 
 
 
355 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  92.61 
 
 
354 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  80.99 
 
 
362 aa  544  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  61.89 
 
 
341 aa  424  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  57.87 
 
 
359 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  55.84 
 
 
333 aa  361  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  57.14 
 
 
345 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  56.86 
 
 
345 aa  332  6e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  48.25 
 
 
380 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  56.94 
 
 
341 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  49.15 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  47.96 
 
 
364 aa  308  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  46.76 
 
 
380 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  49.16 
 
 
348 aa  299  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  45.51 
 
 
353 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.87 
 
 
355 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  47.86 
 
 
379 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  47.69 
 
 
390 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  44.99 
 
 
353 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  49.07 
 
 
422 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  46.69 
 
 
348 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  48.84 
 
 
419 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  44.35 
 
 
359 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  47.04 
 
 
365 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  42.98 
 
 
355 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  45.89 
 
 
363 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  45.61 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  45.68 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  50.95 
 
 
383 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  50 
 
 
374 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  49.04 
 
 
339 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  45.14 
 
 
319 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  46.31 
 
 
364 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  45.2 
 
 
360 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  45.04 
 
 
360 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  47.4 
 
 
361 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.35 
 
 
355 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  43.59 
 
 
325 aa  259  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  41.53 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  40.57 
 
 
350 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  44.1 
 
 
339 aa  247  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  38.99 
 
 
356 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  29.21 
 
 
294 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  30.42 
 
 
323 aa  96.7  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  29.56 
 
 
307 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  26.56 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  28.57 
 
 
324 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>