51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1787 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  96.62 
 
 
355 aa  644    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  693    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  693    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  93.47 
 
 
354 aa  627  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  80.44 
 
 
362 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  61.32 
 
 
341 aa  423  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  57.58 
 
 
359 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  55.84 
 
 
333 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  56.98 
 
 
345 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  56.7 
 
 
345 aa  331  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  47.57 
 
 
380 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  56.36 
 
 
341 aa  322  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  48.59 
 
 
348 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  46.79 
 
 
380 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  48.5 
 
 
364 aa  312  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  49.72 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  46.48 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  48.84 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  48.11 
 
 
379 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  45.35 
 
 
353 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  50 
 
 
422 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  52.35 
 
 
383 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  48.84 
 
 
419 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  46.18 
 
 
363 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  46.18 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  46.48 
 
 
365 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  45.22 
 
 
359 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  50.81 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  46.11 
 
 
348 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  45.68 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  44.41 
 
 
353 aa  285  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  42.42 
 
 
355 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  49.36 
 
 
339 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  46.89 
 
 
364 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  44.51 
 
 
319 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  44.91 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  44.89 
 
 
360 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  43.3 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  47.56 
 
 
361 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  44.73 
 
 
360 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  41.64 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  41.09 
 
 
350 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  44.1 
 
 
339 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  38.72 
 
 
356 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  30.32 
 
 
309 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  28.89 
 
 
294 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  30.85 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  30.31 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  28.35 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  32.11 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  29.25 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>