52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3310 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  58.04 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  57.79 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  53.32 
 
 		 380 aa  371  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  56.05 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  54.21 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  54.32 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  56.8 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  50.68 
 
 		 339 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  56.23 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  49.6 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  47.97 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  47.28 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  47.28 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  53.72 
 
 		 345 aa  308  9e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  53.72 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  49.18 
 
 		 362 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  49.43 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  53.35 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  52.12 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  46.74 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  47.8 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  43.57 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  43.4 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  45.01 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  44.8 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  43.09 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  43.48 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  47.98 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  45.59 
 
 		 319 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  46.5 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  43.87 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  43.87 
 
 		 360 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  45.5 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  41.96 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  43.82 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  40.81 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  42.43 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  45.03 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  40.05 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  40.11 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  40.24 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  39.89 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  31.42 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  29.27 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  32.04 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  31.29 
 
 		 308 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  28.68 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  36.84 
 
 		 255 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  28.57 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>