56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0472 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  99.71 
 
 
345 aa  683    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  685    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  81.38 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  55.71 
 
 
355 aa  362  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  55.14 
 
 
355 aa  362  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  55.14 
 
 
355 aa  362  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  54.73 
 
 
341 aa  358  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  54.44 
 
 
333 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  56.86 
 
 
354 aa  349  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  53.72 
 
 
380 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  57.31 
 
 
359 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  55.9 
 
 
362 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  54.65 
 
 
348 aa  338  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  50.67 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  46.78 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  49.47 
 
 
379 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  46.78 
 
 
353 aa  298  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  46.92 
 
 
363 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  48.47 
 
 
364 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  46.33 
 
 
363 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  46.78 
 
 
348 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  45.72 
 
 
359 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  45.56 
 
 
324 aa  281  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  46.39 
 
 
419 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  46.76 
 
 
355 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  47.66 
 
 
422 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  46.61 
 
 
353 aa  279  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  50.48 
 
 
383 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  48.54 
 
 
339 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  46.63 
 
 
364 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  46.15 
 
 
365 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  50.95 
 
 
374 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  48.18 
 
 
319 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  47.43 
 
 
390 aa  268  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  44.38 
 
 
360 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  44.38 
 
 
360 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  45.6 
 
 
361 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  44.21 
 
 
348 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  43.15 
 
 
350 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  48.13 
 
 
339 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  49.06 
 
 
365 aa  258  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  44.06 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  44.98 
 
 
355 aa  248  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  39.87 
 
 
356 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  31.95 
 
 
309 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  31.13 
 
 
323 aa  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  31.32 
 
 
294 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  31.15 
 
 
307 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  28.81 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  36.14 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  28.8 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  32.53 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  34.62 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  31 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  28.1 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  29.81 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>